La Comisión Europea lleva a España ante el Tribunal de Justicia de la UE por no haber tomado las medidas adecuadas para proteger las masas de agua subterránea que alimentan los Humedales de Doñana, como exige la legislación de aguas de la UE y la Directiva Marco del Agua. España tampoco está tomando las medidas adecuadas para prevenir el deterioro de los hábitats protegidos en estos humedales, en violación de la legislación de la UE sobre naturaleza.
Los Humedales de Doñana se encuentran entre los más extensos de Europa con una gran diversidad de ecosistemas. Albergan una considerable variedad de fauna y flora, incluidas especies en peligro crítico de extinción, como el águila imperial, el lince ibérico y la tortuga muslo espuela. Por su ubicación estratégica, Doñana también forma parte de la ruta migratoria de millones de aves cada año. Esta biodiversidad única está protegida por la Directiva de Hábitats y la Directiva de Aves, ya que el Parque Nacional de Doñana y sus alrededores contienen varias áreas con lugares designados Natura 2000.
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